北京军区总医院成立于1913年，是一所历史悠久、设备精良、技术领先，集预防、保健、医疗、科研、教学、康复为一体的大型综合性三级甲等医院。，也是第二军医大学北京临床医学院、第三军医大学、第四军医大学临床教学医院；是“新型农村合作医疗”、“中国红十字基金会”、“中国青少年发展基金会”、“城市医疗保险”等定点医院。
北京军区总医院日接诊能力4000 人次以上；展开床位1600 余张，下设50个专科、70多个专业。2005年12月在搜狐网举办的最受百姓信赖三甲医院评选活动中，医院荣登榜首。2007、2008年39健康网、新浪网联合主办的中国健康年度总评榜评选中，医院连续荣登北京最受欢迎三甲医院榜首。 全军专科中心有：全军创伤骨科研究所、全军普通外科中心、全军肝病治疗中心、全军计划生育优生优育技术中心、全军肿瘤内科诊治中心、全军皮肤病诊治中心、全军药物研究重点实验室。军区专科中心有：军区儿科研究所暨北京军区总医院附属八一儿童医院、军区心肺血管疾病研究所、军区消化内科研究诊疗中心、军区神经内科研究诊疗中心、军区呼吸内科研究诊疗中心、军区胸外科研究诊疗中心、军区诊断病理研究中心、军区烧伤整形重点专科。
医院拥有卫生技术人员2600余名；有1个博士、博士后科研工作站；高级职称500名，硕士、博士研究生400名；教授、副教授200 名，博士、硕士生导师80名；享受政府津贴的知名专家50名。目前设备总值5.5亿元以上；与25家医院建立了网上会诊，与近百家地方医院建立了技术协作网，为患者进京就医开通了绿色通道。
医院认真落实胡锦涛总书记“听党指挥、服务人民、英勇善战”的指示和医院党委提出的“服务、质量、效率、科研、和谐、文化”的十二字方针，在军地有关部门领导下，积极参加国家卫生事业改革，在为兵为民服务、构建和谐社会方面继续走在全社会前列。